Система QuantStudio™ 3D Digital PCR System применяется в таких приложениях, где требуется крайне высокая чувствительность и точность в количественной оценке нуклеиновых кислот. Для этого используется метод цифровой ПЦР (digital PCR), когда объем одной реакции разбивается на множество микрореакторов, в каждом из которых и проходит амплификация целевого участка ДНК. В системе QuantStudio™ 3D анализ проводится с использованием нанофлуидных чипов с 20 000 независимыми реакционными объемами.

 

Приложения:

• Абсолютный подсчет молекул ДНК

• Подготовка молекулярных стандартов и контролей

• Оценка концентрации библиотек для секвенирования нового поколения

• Оценка копийности генов (CNV)

• Детекция патогенов, оценка вирусной нагрузки

• Детекция редких событий (например, соматические мутации в онкологии)

• Мониторинг семян и продуктов на наличие ГМО контаминации

 

Особенности:

• Использование одноразовых чипов с 20 000 отдельными независимыми лунками для проведения цифровой ПЦР

• 3 канала детекции (FAM, VIC, ROX)

• Использование готовых наборов на основе технологии TaqMan

• Крайне простой и быстрый рабочий процесс и выдача результата в формате значения количества копий на микролитр

• Стартовая концентрация реакционной смеси для анализа – 20 мкл

• Одновременная амплификация до 24 чипов и считывание результатов с 1 чипа менее чем за 1 минуту

• Нет необходимости использования молекулярных стандартов и референсов

• Крайне простая загрузка образца, исключающая риски контаминации

• Источник освещения LED обеспечивает продолжительность работы оптической системы (не менее 60 000 часов работы)

• Сенсорный дисплей позволяет работать без использования компьютера, полученные данные можно отправлять в облако или хранить на Flash-накопителе (USB-вход)

• Малые габариты прибора позволяют разместить его в любой лаборатории (210 x 230 x 130 мм, вес 2,4 кг)

 

Цифровая ПЦР

При цифровой ПЦР (digital PCR) реакционная смесь разбивается на множество микрореакторов, в каждом из которых проходит индивидуальная ПЦР. При таком подходе возможно определение даже низких концентраций ДНК (до 1 копии), без использования молекулярных стандартов и референсов. Оценка количества молекул нуклеиновых кислот проводится на основании распределения Пуассона, так как распределение молекул ДНК по лункам микрочипа происходит случайным образом, то есть определенная лунка может содержать или не содержать молекулу ДНК. После амплификации оценивается количество позитивных (содержащих молекулу НК) и негативных (не содержащих молекул НК) ПЦР, при этом оценка начального (стартового) количества материала не зависит от количества циклов ПЦР.

При проведении цифровой ПЦР подсчитывается количество позитивных (черные точки) и негативных (белые точки) ПЦР для оценки количества целевых молекул.

 

Описание рабочего процесса на QuantStudio™ 3D Digital PCR System

При проведении цифровой ПЦР образцы наносятся на чип с помощью специального загрузчика чипов, этот процесс занимает меньше 1 минуты. Заполненный чип переносится в амплификатор ProFlex со специальным блоком, после чего проводится ПЦР, детекция результатов осуществляется на QuantStudio 3D. Полученные данные можно отправлять в облако или переносить на Flash-карте.

Смесь для проведенияПЦР	Автозагрузчик чипов	Амплификатор ProFlex	Система QuantStudio™ 3D Digital PCR System

 

Технические характеристики

Формат блока	одноразовый чип
Размер чипа, точек	20 000
Объем реакции на чип, мкл	20
Объем лунки чипа, нл	0,8
Время загрузки 1 чипа	менее 1 минуты
Время прочтения 1 чипа	менее 1 минуты
Детектируемые красители	FAM, VIC, ROX
Оптическая система	LED
Габариты прибора, мм	210 x 232 x 135
Вес, кг	2,4

 

Видео описания рабочего процесса для QuantStudio 3D Digital PCR